سیتوژنتیک به عنوان شاخه ای مهم از ژنتیک و ارتباط نزدیک با سلول شناسی، به بررسی ساختار و عملکرد کروموزومها در سلولهای گیاهی میپردازد و یک دانش بنیادی در ژنتیک گیاهی به شمار می آید. شناخت خصوصیات کروموزومی گیاهان (کاریوتیپ) به عنوان یکی از ویژگی های مهم هر گونه، کاربردهای مهمی در شناسایی و طبقه بندی گیاهان دارد. همچنین مطالعۀ ساختار و رفتار کروموزومها در سلولهای گیاهی، اطلاعات بنیادی در خصوص ساختار ژنتیکی، نحوه انتقال صفات و الگوهای وراثت در گیاهان فراهم میکند.